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戊二醛屬消毒劑，具有廣譜、低毒、對金屬腐蝕性小、受有機物影響小、穩定性好等特點。適用于醫療器械和耐濕忌熱的精密儀器的消毒與滅菌。其滅菌濃度為2%，市售戊二醛主要有：2%堿性戊二醛和2%強化酸性戊二醛兩種。

堿性戊二醛常用于醫療器械滅菌，使用前應加入適量碳酸氫鈉，搖勻后，靜置1小時，測定pH值。pH在7.5-8.5時，戊二醛的殺菌作用強。

戊二醛殺菌是其單體的作用，當溶液的pH達到6時，這些單體有聚合的趨勢，隨pH上升這種聚合作用極迅速，溶液中即可出現沉淀，形成聚合體后會失去殺菌作用。

因此堿性戊二醛是一種相對不穩定的消毒液，2%強化酸性戊二醛是以聚氧乙烯脂肪醇醚為強化劑，有增強戊二醛殺菌的作用。它的pH低于5，對細菌芽胞的殺滅作用較堿性戊二醛弱，但對病毒的滅活作用較堿性戊二醛強，穩定性較堿性戊二醛好，可連續使用28天。