戊二醛試劑在生產和使用過程中可經口、經皮膚和經呼吸道三種途徑進入人體。結果表明,小鼠、大鼠經口、大鼠經皮膚和小鼠經呼吸道的 LD50 分別為 990 
mg/kg 體重、955 mg/kg 體重、≥8000 mg/kg 體重和 3074 mg/m3,按純戊二醛計,經口( 小鼠、大鼠) 、經皮膚和小鼠經呼吸道的 
LD50 分別為 248 mg/kg 體重、239 mg/kg 體重、≥2000 mg/kg 體重和 768 
mg/m3。根據世界衛生組織的急性毒性分級標準,戊二醛經口和吸入急性毒性均屬于中等毒性物質,經皮膚急性毒性屬于低毒性物質。了戊二醛對斑馬魚的急性毒性實驗,結果 
96 h - LC50為 13. 5 mg/L。根據急性毒性分級標準[1] HJ/T 154 -2004 新化學物質危害評估導則[S].
	  ,戊二醛屬于中等毒性物質( 中等分級標準為 10 mg/L-100 mg/L) 。

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①醫療器械的消毒與滅菌
2%
戊二醛(堿性、酸性、中性)可用于各種不怕濕的醫療器械消毒與滅菌。在常溫下把清潔干燥的器械完全浸入戊二醛水溶液中,30分鐘可達到消毒10小時以上的效果。
無論哪種制劑,在使用時均需先加入0.5%亞硝酸鈉作為防腐劑,但一經加入防腐劑只可保存1個月,堿性戊二醛只可連續使用1-2周。
②內窺鏡的消毒與滅菌
戊二醛是內窺鏡消毒的選藥品。現代內窺鏡的很多種部件不耐高溫而怕腐蝕,對消毒滅菌要求亦愈來愈高。所以,大多內窺鏡都用戊二醛進行消毒或滅菌。
戊二醛消毒或滅菌的正確操作程序是:
先將污染的物品進行無害化處理(內窺鏡可直接清洗),可用0.2%有效氯清洗消毒劑清洗內窺鏡;沖洗,用清水將洗滌劑沖洗干凈;沖洗后再用中性或加酶洗滌劑仔細刷洗;干燥,洗滌后的器械需經過干燥處理;滅菌,將干燥的器械完全浸泡在2%戊二醛溶液內,作用到規定的時間,取出用無菌蒸餾水將殘余戊二醛沖洗干凈即可使用或干燥保存。
③作為一種有機交聯劑
戊二醛在一定條件下能將單體、線型高分子或預聚物轉變成三維網狀結構的物質。戊二醛在1%濃度時,交聯度已達到很高的程度,在此濃度以下,隨濃度下降,交聯度下降,溶脹度和降解率增加。濃度超過1%時,各指標無明顯變化。